A fundação da APAE de Santo André ocorreu em 10 de setembro de 1963, graças a corajosa determinação e esperança de um grupo de pessoas da comunidade, preocupados com o problema de crianças e jovens excepcionais existentes em Santo André. Foi então eleita a primeira Diretoria, cabendo a presidência ao Dr. Henrique Calderazzo. Mesmo com as dificuldades e desafios encontrados, grupos gestores constituídos por Rotarianos do Rotary Clube de Santo André desde 1998 se sucedem na administração da entidade e vêem promovendo melhorias contínuas à APAE. Neste período, estes Rotarianos com o auxílio da sociedade conseguiram reformar totalmente o prédio da APAE, aumentaram o número de assistidos diretos de 250 para 450 pessoas e atualmente estão pleiteando recursos com poderes públicos e empresas privadas para reforma e expansão do prédio da APAE.